Poitou-Charentes Nature regroupe à ce jour 12 associations, départementales, régionales et/ou thématiques.

Le GOAS (Groupe Ornithologique Aunis-Saintonge), qui était aussi membre depuis une vingtaine d’années, a été dissous au printemps 2007, tandis que l’APGP (Association pour la Promotion de la Géologie et de la Paléontologie en Poitou-Charentes-Vendée), qui avait adhéré en 2006, a souhaité démissionner de Poitou-Charentes Nature en 2011 compte tenu de sa "mise en sommeil" actuelle.